Paper Code Joint Analysis — 论文代码联合分析

论文-代码联合分析目的 使用此技能来使代码成为阅读论文的证据层。输出必须帮助读者回答：论文声称什么，代码在哪里实现了它，每个实验如何运行，论文省略了什么，以及如何编辑以改变提出的方法。默认的用户面向语言是中文。保持论文标题、代码标识符、文件路径、命令名称、类名称、方法名称和标准缩写在其原始形式，但以中文书写报告、读者标签、解释、验证注释、图例和省略分析，除非用户明确请求其他语言。静态读者是可重用的代码。不要为新论文重写页面逻辑。新的分析必须通过稳定的工件合同（analysis_bundle.json 加上固定名称的 Markdown 文件）来提供相同的读者模板。如果新论文需要额外的内容，请将其添加到包字段或固定伴侣 Markdown 文件中，而不是创建特定于论文的 JavaScript 或 HTML。每次完整运行都必须产生人类可读的 Markdown 文档和固定机器可读的包。Markdown 文件是人读取的学习记录；analysis_bundle.json 是读者模板加载的紧凑结构化数据。不要用网页替换 Markdown 报告，也不要将长叙述分析仅放在 JSON 中。对于长输出，不要尝试绕过硬模型/ API 限制。首选单个文件通过路径传递，当它们适合活动模型/ API 预算时；不要在 shell 命令中嵌入大内容。仅在文件太大以至于无法安全地一步构造时，或者当操作系统/工具限制（如 Windows 命令行长度）成为阻碍因素时，才使用 references/large-artifact-policy.md 中的 chunk 工作流。模块架构 此技能是自包含和模块驱动的。不要在运行时调用 paper-toon-deep-reader。其 Gate-1 文本报告质量标准已被内部化为本地模块，因此执行仅依赖于此技能自己的 SKILL.md、modules/、references/、scripts/ 和 assets/。根据关注点使用模块：

• modules/deep-reading-gate1.md：paper_reading_report.md 的完整学习报告深度。
• modules/question-led-code-reading.md：paper_questions_for_code.md 和 analysis_bundle.json.paper_questions 的 PDF 模糊性账本和代码证据状态。
• modules/modify-method-guide.md：根据论文提出的新模型或算法的方法级扩展点。
• modules/fixed-artifacts-and-reader.md：固定输出文件、可重用的读者、公式渲染和验证命令。

独立升级模块。如果未来工作流仅更改阅读标准，请替换 modules/deep-reading-gate1.md。如果它更改输出数据形状，请更新 references/analysis-bundle.schema.json、验证器、读者模板和模式版本。强制工作流 接收和范围 验证论文身份、PDF/源可用性、仓库提交、README、入口脚本和分析目标。声明分析范围并忽略与论文方法或实验无关的代码。如果没有请求训练，请仅进行静态分析并说明这一点。论文通行 应用本地模块 modules/deep-reading-gate1.md 加上 references/deep-reading-overlay.md。paper_reading_report.md 的深度应与 Gate-1 级别的文本报告保持一致，同时排除漫画/故事板/ PDF 阶段。保持 paper_reading_report.md 为论文专用：不要在此报告中包含仓库路径、代码行引用、类/方法映射或代码披露事实。它是独立的学习导向的论文深度阅读。提取方法组件、符号、方程、算法、实验部分、表格、图表、基线、消融和补充设置。在使用代码作为证据之前，按照 modules/question-led-code-reading.md 并从深度阅读报告和 PDF 中写出一个问题账本：论文没有明确说明什么，哪里公式/目标/模型流程不明确，哪里陈述似乎不一致，哪里实验设置缺失。将人类可读版本存储在 paper_questions_for_code.md 中，将结构化版本存储在 analysis_bundle.json.paper_questions 中。将方程式保留为可渲染的数学形式，而不是仅仅是散文描述。当用户请求“人类可读”、“人类书写”或 Word 样式的公式时，生成可渲染的公式，而不是散文描述。将直觉放在单独的解释段落中。不要将原始 LaTeX 作为正常页面内容公开。Markdown 可以在围栏的数学块中存储公式，但静态读者必须将其渲染为可渲染的公式，并在渲染失败时隐藏源代码。仓库通行 映射入口点、配置、数据集、模型、训练/推理循环、域关键执行路径、损失、指标和日志。使用真实的类、函数、方法、参数和文件名称。不要发明包装器或参数名称。为每个重要声明记录行范围。使用真实的类、函数、方法、参数和文件名称。不要发明包装器或参数名称。为每个重要声明记录行范围。使用